Важным отличием мультипробиотиков является приближение их состава и функций к естественной дружественной микрофлоре здорового человека, которая характеризуется огромным видовым многообразием, широким спектром полезных свойств и взаимовыгодными отношениями между отдельными группами полезных бактерий. В то время, как большинство многокомпонентных пробиотиков представляют собой механическую смесь отдельных микробных культур, в мультипробиотиках бактерии находятся в форме устойчивого многофункционального симбиоза. В таком симбиотическом комплексе полезные свойства каждого микроорганизма рационально взаимодополняются, в связи с чем мультипробиотики способны оказывать широкий спектр оздоровительного воздействия на организм человека.